قال الدكتور أحمد الطيب شيخ الأزهر، إن الحديث عن وجود اضطهاد للمسيحيين في مصر هو كلام عار تماما عن الصحة، فالعلاقة بين المسلمين والمسيحيين في مصر هي علاقة قوية ومتجذرة، ولم يحدث يومًا أن وقعت معركة بين المسلمين والمسيحيين في مصر على الرغم من تعايشهما على مدار أكثر من ألف عام، مشيرًا إلى ما يحدث من توترات أحيانا هي توترات اجتماعية بالأساس يحاول البعض فيما بعد أن يضفي عليها بعدًا دينيًا.
وحذر شيخ الأزهر خلال حديثه للتلفزيون الألماني من أن هناك مخططات خارجية تريد ضرب الاستقرار في مصر كما حدث في دول عربية مجاورة، والتي كان السبب ورائها إثارة النعرة المذهبية ومن يقتتلون فيها هم أبناء الدين الواحد من السنة والشيعة، وقد أريد لمصر أن يقتتل أهلها ولكن هذه المرة بين المسلمين والمسيحيين إلا أن هذه المخططات فشلت والحمدلله في النيل من وحدة الشعب المصري.
وردًا على سؤال حول مدى إمكانية التحاق الطلاب المسيحيين بجامعة الأزهر، قال الإمام الأكبر: إن هناك شروطًا للالتحاق بجامعة الأزهر من بينها حفظ القرآن الكريم كاملًا حيث يتم تأهيل الطلاب لذلك خلال المرحلتين الإعدادية والثانوية الأزهرية كما يتم تأهيلهم شرعيًا لإعمال العقل وفهم النصوص، موضحًا أن من لا تنطبق عليه هذه الشروط لا يمكن التحاقه بجامعة الأزهر وفي مقدمتهم الطلاب المسلمين الحاصلون على الثانوية العامة، مما يعني أن الأمر لا يتعلق بالدين، ولكن يتعلق في المقام الأول بتأهيل الطالب.