تنفذ القوات البحرية بالتعاون مع الأفرع الرئيسية للقوات المسلحة، منظومة عمل متكاملة لمجابهة التهديدات والتحديات النمطية وغير النمطية التي تستهدف الأمن القومي المصري علي كل الاتجاهات الاستراتيجية.
وتقوم وحدات القوات البحرية بدور حيوي علي مدار الساعة بتأمين الأهداف الاستراتيجية بالبحر وحماية الموانئ والسواحل المصرية بجانب دورها في مكافحة الإرهاب وقطع خطوط الإمداد اللوجستية والتسلل والتهريب عبر البحر والقيام بمواجهة قوية حاسمة ضد أى عمل إرهابى فى نطاق مسئوليتها.
وأدي التواجد المستمر والفعال لابطال ومقاتلي القوات البحرية بالبحر إلى مجابهة تنامى أنشطة التهريب وأعمال الهجرة غير الشرعية على المستوى الإقليمى خاصة فى ظل الظروف الراهنة والمعاونة بأعمال البحث والإنقاذ وتقديم المعاونة بالإنقاذ للسفن والإشتراك في أعمال التأمين وضمان حرية الملاحة البحرية الدولية علي الحدود الساحلية.
وشهدت القوات البحرية طفرة هائلة في برامج التسليح والمنظومات الفنية والادارية وفقا لرؤي خلاقة تتناسب مع تطور الفكر الاستراتيجي للقوات المسلحة وامتلاك قوة بحرية فاعلة ومؤثرة في محيطها الإقليمي بما يخدم المصالح العليا للدولة المصرية وتأمين وحماية الإكتشافات الحالية لمصادر الطاقة بالمنطقة الإقتصادية الخالصة والحفاظ علي مقدرات الشعب المصري وثروات وتطلعات وآمال الاجيال القادمة نحو حياة أفضل.
